短發(fā)夾RNA(short hairpin RNA, shRNA)是一種經(jīng)由載體遞送并穩(wěn)定表達(dá)的RNA分子,其可在細(xì)胞內(nèi)被加工成小干擾 RNA(siRNA),進(jìn)而引導(dǎo)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)降解靶信使RNA(mRNA),從而實(shí)現(xiàn)特異性基因敲低。單個(gè) shRNA 實(shí)驗(yàn)只能研究一個(gè)特定基因的功能。然而,生物學(xué)中的絕大多數(shù)現(xiàn)象(如細(xì)胞增殖、死亡、分化、癌癥發(fā)生、藥物反應(yīng)等)都不是由單個(gè)基因決定的,而是由復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)共同調(diào)控的。因此,要全面理解這些過(guò)程,就需要一種能夠同時(shí)、系統(tǒng)地干擾大量基因并進(jìn)行篩選的方法。
建立 shRNA 文庫(kù)的根本原因是生物學(xué)問(wèn)題的復(fù)雜性,其核心作用是將 RNAi 技術(shù)轉(zhuǎn)化為一種強(qiáng)大的大規(guī)模發(fā)現(xiàn)工具。泓迅生物利用專利的Syno?合成技術(shù)平臺(tái),可以快速高效地實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量 shRNA 文庫(kù)構(gòu)建,滿足不同客戶對(duì)文庫(kù)的定制化需求,為大規(guī)模功能缺失篩選提供高效且經(jīng)濟(jì)的解決方案。
服務(wù)項(xiàng)目 | 服務(wù)詳情 | 周期 |
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shRNA 設(shè)計(jì) | 針對(duì)目標(biāo)基因進(jìn)行 shRNA 序列設(shè)計(jì) 每個(gè)基因設(shè)計(jì)3-6條 shRNA(無(wú)物種限制) | 2-3天 |
芯片合成 | 將所設(shè)計(jì)的所有 shRNA 及陰性對(duì)照合成在一張芯片上 | 3-4周 |
shRNA 文庫(kù)構(gòu)建 | 將 shRNA 構(gòu)建到客戶的目標(biāo)載體上 | 4周 |
文庫(kù)質(zhì)粒大抽 | 根據(jù)發(fā)貨量進(jìn)行轉(zhuǎn)染級(jí)質(zhì)粒抽提 | 1周 |
文庫(kù)質(zhì)檢及 NGS 驗(yàn)證 | 庫(kù)容量大于100x、覆蓋率>90%,文庫(kù)正確率>65% | 2-3周 |
病毒包裝 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |